metabolomics-workbench-database

Umożliwia dostęp do Metabolomics Workbench – największego repozytorium badań metabolomicznych finansowanego przez NIH. Zawiera ponad 4200 przetworzonych badań, standardową nomenklaturę metabolitów (RefMet) i zaawansowane wyszukiwanie danych spektrometrycznych (GC-MS, LC-MS, NMR). Przeszukuj struktury metabolitów, pobieraj dane cząsteczkowe, wyszukuj po m/z i identyfikuj asocjacje gen-protein-metabolit dla odkrywania biomarkerów i badań metabolomicznych.

1. Zainstaluj umiejętność w swoim środowisku Claude/Copilot, dodając plik skill do katalogu umiejętności agenta. 2. Zainicjuj połączenie z REST API Metabolomics Workbench – nie wymaga klucza API, wszystkie zapytania kierowane są bezpośrednio do publicznego endpointa metabolomicsworkbench.org. 3. Aby wyszukać metabolit, użyj identyfikatora z obsługiwanych baz danych (PubChem CID, InChI Key, KEGG ID, HMDB ID) – na przykład zapytaj o strukturę lub właściwości konkretnego związku chemicznego. 4. Pobieraj dane studium, metadane eksperymentalne i wyniki – umiejętność zwraca informacje o warunkach badania, próbkach i wynikach analizy spektrometrycznej. 5. Wykonuj wyszukiwania masowe po wartościach m/z (stosunek masy do ładunku) dla identyfikacji nieznanych metabolitów na podstawie danych spektrometrycznych. 6. Krzyżuj wyniki między bazami danych – umiejętność automatycznie mapuje identyfikatory metabolitów między PubChem, KEGG, HMDB i innymi standardowymi bazami dla kompleksowej analizy.