Toolverse
Wszystkie skille

kegg-database

autor: davila7

Bezpośredni dostęp do bazy KEGG dla analizy szlaków metabolicznych i interakcji molekularnych.

Instalacja

Wybierz klienta i sklonuj repozytorium do odpowiedniego katalogu skilli.

Instalacja

Szybkie info

Autor
davila7
Kategoria
Backend
Wyświetlenia
1

O skillu

Umożliwia bezpośredni dostęp do REST API bazy KEGG (Kyoto Encyclopedia of Genes and Genomes) dla badań akademickich. Analizuj szlaki metaboliczne, mapuj geny na szlaki, badaj interakcje leków oraz konwertuj identyfikatory biologiczne. Zawiera funkcje pomocnicze w Pythonie do wszystkich operacji REST API KEGG. Idealna dla naukowców pracujących z danymi biologicznymi, którzy potrzebują precyzyjnej kontroli nad zapytaniami do KEGG lub integracji z przepływami pracy opartymi na REST.

Jak używać

  1. Zainstaluj umiejętność w swoim środowisku Claude, upewniając się, że masz dostęp do biblioteki scripts/kegg_api.py zawierającej funkcje pomocnicze. 2. Zaimportuj potrzebną funkcję z modułu — na przykład from scripts.kegg_api import kegg_info do pobrania metadanych bazy lub from scripts.kegg_api import kegg_list do wyliczenia wpisów. 3. Określ, jakie dane potrzebujesz: informacje o bazie danych (struktura, wersja), listę szlaków dla organizmu, geny, związki chemiczne czy enzymy. 4. Wywołaj odpowiednią funkcję z parametrem bazy — przykładowo kegg_info('pathway') dla informacji o szlakach lub kegg_list('hsa') dla ludzkiego genomu. 5. Przetwórz zwrócone dane JSON w swoim skrypcie — wyniki zawierają identyfikatory wpisów, nazwy i metadane potrzebne do dalszej analizy. 6. Pamiętaj, że API KEGG dostępne jest wyłącznie do użytku akademickiego — upewnij się, że Twoje zastosowanie spełnia wymogi licencji akademickiej.

Podobne skille