instrument-data-to-allotrope

Automatycznie przekształcaj pliki wyjściowe z urządzeń laboratoryjnych (PDF, CSV, Excel, TXT) do standardowego formatu Allotrope Simple Model (ASM) w JSON lub płaskim CSV. Narzędzie automatycznie rozpoznaje typ przyrządu, generuje gotowy kod Python dla inżynierów danych i przygotowuje dane do importu do systemów LIMS, ELN lub jezior danych. Idealne do standaryzacji danych laboratoryjnych i automatyzacji potoków przetwarzania.

1. Przygotuj plik wyjściowy z przyrządu laboratoryjnego w formacie PDF, CSV, Excel lub TXT. Jeśli znasz typ przyrządu, zanotuj go — narzędzie może go również automatycznie wykryć z zawartości pliku.

2. Uruchom umiejętność, przekazując plik i opcjonalnie typ przyrządu. Narzędzie przeanalizuje zawartość i automatycznie wybierze odpowiedni parser.

3. Otrzymasz trzy wyjścia: pełny plik JSON w formacie Allotrope Simple Model (ASM) z pełną strukturą semantyczną, spłaszczony plik CSV w formacie tabelarycznym gotowy do bezpośredniego importu, oraz kod Python, który możesz przekazać zespołowi inżynierów danych do integracji z produkcyjnymi potokami.

4. Jeśli planujesz dostosować umiejętność do swoich potrzeb, zmodyfikuj pliki w katalogu references/ aby zawierały schematy lub mapowania ontologiczne specyficzne dla Twojej organizacji.

5. Dla zaawansowanych przypadków połącz umiejętność z serwerem MCP, który ma dostęp do Twojego systemu LIMS, katalogu danych lub rejestru schematów, aby automatycznie pobierać i walidować schematy.

6. Importuj wygenerowane pliki CSV lub JSON bezpośrednio do systemu LIMS, ELN lub jeziora danych — dane są już w standardowym formacie gotowym do dalszej analizy.