imaging-data-commons
Dostęp do publicznych danych onkologicznych z archiwum NCI — bez logowania, gotowe do treningu AI
Instalacja
Wybierz klienta i sklonuj repozytorium do odpowiedniego katalogu skilli.
Instalacja
O skillu
Umożliwia wyszukiwanie i pobieranie darmowych danych obrazowych z Imaging Data Commons — archiwum Narodowego Instytutu Zdrowia (NCI) zawierającego tomografię (CT), rezonans (MR), pozytonową emisję (PET) i obrazy patologiczne. Przeszukuj zbiory metadanych, wizualizuj wyniki w przeglądarce, sprawdzaj licencje. Idealne dla badaczy i inżynierów pracujących nad modelami AI w medycynie. Brak wymogu uwierzytelniania.
Jak używać
Zainstaluj lub zaktualizuj pakiet idc-index do wersji 0.11.10 — uruchom w Pythonie kod weryfikacyjny z dokumentacji, aby sprawdzić aktualną wersję i w razie potrzeby uaktualnić za pomocą pip3.
Zaimportuj IDCClient z biblioteki idc_index i utwórz instancję klienta — to połączy Cię z archiwum danych IDC w wersji v23.
Sprawdź dostępne kolekcje i liczbę serii obrazowych za pomocą zapytania SQL — użyj metody sql_query() aby zobaczyć skalę dostępnych danych onkologicznych.
Sformułuj zapytanie filtrujące po metadanych — określ typ obrazowania (CT, MR, PET), lokalizację anatomiczną, diagnozę lub inne kryteria, aby zawęzić wyniki do potrzebnych danych.
Pobierz wybrane serie obrazów — idc-index obsługuje masowe pobieranie bez konieczności logowania; dane są dostępne na licencjach CC-BY lub CC-NC, które musisz respektować w swojej pracy.
Wizualizuj i weryfikuj dane w przeglądarce — przed użyciem w treningu sprawdź licencje poszczególnych zbiorów i upewnij się, że są zgodne z Twoim projektem.