clinpgx-database

ClinPGx to kompleksowa baza danych farmakogenetyki klinicznej, następca PharmGKB. Umożliwia wyszukiwanie interakcji gen-lek, wytycznych CPIC, funkcji alleli oraz informacji o metabolizmie leków. Narzędzie wspiera decyzje terapeutyczne oparte na genotypie pacjenta – od analizy wariantów genetycznych wpływających na metabolizm i skuteczność leków, przez dostęp do wytycznych opartych na dowodach naukowych, aż po rekomendacje dawkowania. Idealne dla lekarzy, genetyków klinicznych i specjalistów medycyny precyzyjnej pracujących z testami farmakogenetycznymi.

1. Zainstaluj wymagane biblioteki Pythona poleceniem uv pip install requests. Umożliwi to komunikację z API ClinPGx.
2. Połącz się z bazą danych, używając punktu końcowego API: https://api.clinpgx.org/v1/. Pamiętaj o limitach – maksymalnie 2 żądania na sekundę, aby uniknąć błędu HTTP 429.
3. Sformułuj zapytanie dotyczące interesującego Cię genu lub leku – na przykład wyszukaj, jak warianty genetyczne wpływają na metabolizm konkretnego leku lub jakie są wytyczne CPIC dla danej pary gen-lek.
4. Pobierz wyniki zawierające informacje o funkcji alleli, fenotypach, częstości wariantów oraz rekomendacjach dawkowania opartych na genotypie pacjenta.
5. Wykorzystaj uzyskane dane do wsparcia decyzji klinicznych – dostosuj dawkowanie leku na podstawie profilu genetycznego pacjenta lub zidentyfikuj potencjalne ryzyka niekorzystnych reakcji na lek związane z wariantami genetycznymi.